16S rRNA 為原核生物核糖體小亞基的重要組成，序列包含數個保守區域和 9 個高變區域，其中高變區具有屬或種的特異性，被認為是最適於細菌系統發育和分類鑑定的指標。因此利用 NGS 次世代定序技術對該區域中的序列進行定序已是研究環境微生物多樣性及群落組成差異的重要策略之一。

服務流程
服務週期：樣品通過檢測啟動後，40 個工作天（含分析）。

分析流程

基於 Illumina MiSeq 定序平台，利用雙端定序（Paired-End），透過 Reads 拼接過濾以及 OTU（Operational Taxonomic Units） 聚類，以進行物種注釋及豐度分析，不僅可以揭示樣品物種構成，還能進一步透過 α 多樣性分析（Alpha Diversity）及 β 多樣性分析（Beta Diversity）探討樣品之間的差異。
統計分析包含 LEfSe 、metastats / Metagenomeseq、ANOSIM 以及 MRPP 分析，須提供分組資訊，且每組最少 3 個樣品。